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Alexander Knoll ist Biologe. Für seine Promotion am Karlsruher Institut für Technologie versucht er, die DNA-Reparatur und -Rekombination in Pflanzen besser zu verstehen.
Emanuel Heitlinger promoviert an den Universitäten Karlsruhe und Edinburgh. Er untersucht mit Hilfe von Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung die Evolution eines Wirt-Parasit-Systems.
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12.06.09 · 09:48 Uhr
Wie lang ists her?
Kategorie: Naturwissenschaften · Kommentare: 3
Ich habe gerade die tolle Time Tree Seite gefunden. Das ist wirklich ein praktischer Service, der mir sicher weiterhelfen wird. Immer wieder kriege ich von Studenten die Frage gestellt, wann der gemeinsame Vorfahre von verschiedenen Organismen lebte.
Das lässt sich heute nicht nur über die Datierung von Fossilien, sondern auch mit Hilfe von DNA- und Proteinsequenzen abschätzen - sofern man die Mutationsrate einigermaßen gut kennt. Die sogenannte molekulare Uhr sagt einem dann: Zwischen Art A und B gibt es X Unterschiede in der Sequenz, und pro Million Jahre treten genau Y Unterschiede auf. So kann dann auf das ungefähre Alter der Aufspaltung von A und B zurückgeschlossen werden.
Bei Time Tree kann man nun zwei Arten oder auch größere Taxa eingeben, und bekommt (sofern Daten vorhanden sind) einen relativ genauen Wert für die Aufspaltung dieser Linie zurück.
Für das Paar Mensch und Schimpanse erhält man beispielsweise 6,5 bis 6,3 Millionen Jahre. Dieser Wert sollte auch recht stabil sein, weil in seine Berechnung hunderte Gene aus insgesamt 50 Studien eingingen (die alle gelistet und verlinkt sind.
Problematischer sieht es bei größeren Abständen aus. Doch sogar die sehr frühe Aufspaltung Pflanzen und Tiere/Pilze ist immerhin noch durch zehn Studien gestützt, die gemeinsam auf ungefähr 1,4 Milliarden Jahre kommen.
Wenn man mit diesen Daten arbeitet, sollte man aber auf jeden Fall im Hinterkopf behalten, dass die Time Tree Seite zwar einen genauen Wert angibt, es sich dabei aber nur um den Mittelwert einer ganzen Reihe von Schätzungen handelt - teilweise von Publikationen, die sich sogar stark unterscheiden können.
Auf der Time Tree Seite gibt es auch noch jede Menge an interessantem, kostenlosem (!) Material. Die Daten wurden in dem Buch "The Timetree of Life" veröffentlicht, das den typischen Preis eines naturwissenschaftlichen Fachbuches hat. Alle Kapitel stehen jedoch offen als PDFs online bereit. Außerdem kann man dort auch ein schönes Poster herunterladen.
Autor: Alexander· 3 Kommentare· Permalink· Trackback-URL
Arabidopsis· Datierung· Evolution· Fossilien· Mensch· molekulare Uhr· Schimpanse· Time Tree
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Kommentare (3)
Sehr sehr gute Seite, super Tool und super Buch.
Ein kleiner Nachteil bei dem Tool ist, dass NCBI Taxonomy als "guide tree" verwendet wird , die nicht unbedingt auf dem neusten Stand ist. Da muss man wenn man den besten Wert will in jeden Fall den vom Buch nehmen. Das soll ja aber noch verbessert werden.
Und die passenden Links um die Schätzung des Tools zu überprüfen bekommt man ja gleich noch schön übersichtlich....
Übrigens: nicht die eigene rechtschreibung verdächtigen, return funktioniert beim tool nicht, schön auf "search" klicken...
Huch? Was ist da mit return? Bei mir ging das eigentlich...
hehe, okay,
typischer fall von Problem abhängig von ... Browser ...OS... Frühstück ... Wetterlage